Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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