Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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