Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms