Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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