Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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PTPRJQ12913 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRJQ12913 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRJQ12913 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRJQ12913 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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