Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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