Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms