Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms