Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EP300Q09472 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EP300Q09472 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EP300Q09472 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EP300Q09472 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EP300Q09472 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EP300Q09472 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EP300Q09472 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EP300Q09472 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EP300Q09472 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms