Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms