Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms