Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms