Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms