Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms