Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOP2BQ02880 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms