Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms