Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms