Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF9Q00978 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms