Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYBPC1Q00872 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms