Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms