Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms