Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms