Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCDC1P59894 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms