Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCBP4P57723 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms