Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms