Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN20P56880 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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