Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAG2P55895 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAG2P55895 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAG2P55895 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAG2P55895 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAG2P55895 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms