Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms