Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR4P51679 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR4P51679 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR4P51679 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCR4P51679 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms