Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms