Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRPC1P48995 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms