Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARCN1P48444 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms