Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCCP43146 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCCP43146 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCCP43146 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCCP43146 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCCP43146 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCCP43146 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCCP43146 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCCP43146 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCCP43146 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCCP43146 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCCP43146 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCCP43146 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCCP43146 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCCP43146 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCCP43146 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCCP43146 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCCP43146 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCCP43146 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms