Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms