Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFBP38117 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFBP38117 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFBP38117 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETFBP38117 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETFBP38117 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETFBP38117 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms