Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGER1P34995 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms