Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms