Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTR2CP28335 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HTR2CP28335 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HTR2CP28335 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms