Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms