Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT1P21579 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT1P21579 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYT1P21579 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT1P21579 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms