Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms