Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms