Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMY2BP19961 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms