Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHCEP18577 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHCEP18577 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHCEP18577 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms