Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPI1P17947 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms