Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOT1P17174 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOT1P17174 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOT1P17174 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms