Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms