Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACTN1P12814 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms