Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms