Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms